2020-12-21 16:35:06
日前,由山東省農業(yè)科學院與東阿阿膠股份有限公司主導,聯(lián)合國內外多家單位共同合作的“德州驢基因組開發(fā)及其產業(yè)化應用”項目傳來捷報,該項目團隊已獲得國際首個組裝到染色體水平的家驢基因組參考圖譜,研究成果于12月9日在Nature子刊《Nature Communications》在線發(fā)表,為馬屬動物遺傳資源保護和利用及家驢基因組育種和遺傳改良提供了重要理論支撐。
驢產業(yè)是我國畜牧業(yè)中的特色產業(yè),在世界上具有領先優(yōu)勢。作為名貴中藥材“阿膠”的重要原料供體,驢其不僅是畜牧業(yè)中的重要一員,也是醫(yī)療康養(yǎng)界的“明星”。作為阿膠產業(yè)核心省份的山東,為深入挖掘優(yōu)良品種“德州驢”的遺傳資源,進一步提升遺傳資源利用水平,山東省農科院聯(lián)合東阿阿膠股份有限公司,于2014年底聯(lián)合發(fā)起了“德州驢基因組開發(fā)及其產業(yè)化應用”項目,經過5年多的不懈攻關,最終成功構建了德州驢染色體水平的高質量參考基因組圖譜。該參考基因組用到了二代測序(Hiseq sequencing)、三代測序(PacBio sequencing)和染色體構象捕獲技術(Hi-C),其Scaffold N50達到93.37 Mb,是目前奇蹄目馬屬動物中連續(xù)性最好的參考基因組。
我國大型優(yōu)良驢品種多為深毛色,小型驢品種及野驢多為淺毛色,其背后的分子機制對于培育優(yōu)良驢品種具有重要意義。德州驢作為深毛色優(yōu)良率品種,其基因組不僅為馬屬動物的起源進化研究提供數(shù)據(jù)基礎,也為優(yōu)良遺傳資源保護和利用、家驢基因組選擇育種和遺傳改良、家驢分子設計育種提供數(shù)據(jù)支撐。作者:張偉 呂兵兵